Оперативная командующая Nerv. Капитан, позже майор. Опекун Синдзи и Аски. Ей 29 лет.
Мисато — полевой командир пилотов Евангелионов, в её обязанности входят оперативное командование и разработка стратегии сражений, а также некоторые бюрократические моменты. Она единственный выживший человек из научной экспедиции под руководством её отца, действия которой спровоцировали Второй удар. После Второго удара находилась в тяжёлом шоке, не разговаривала в течение двух лет. Впоследствии служба в Nerv превратилась для неё в личную месть. В отличие от остального командного состава Nerv, сильно переживает за пилотов. Мисато взяла Синдзи и Аску жить к себе в квартиру, посчитав, что это лучше, чем если бы они жили в одиночестве. С ними также живёт старый лабораторный пингвин Пен-Пен.
Хотя Мисато профессиональна и ответственна на службе, в быту она ведёт себя как стереотипный холостяк — не занимается уборкой, не умеет готовить (в состоянии испортить даже полуфабрикаты), пьёт пиво по утрам. Она училась в одном колледже вместе с Рицуко Акаги и Рёдзи Кадзи. Дружит с Рицуко, но чем больше Мисато узнаёт про секреты Nerv, тем меньше ей доверяет. Была куратором Аски до 2010 года, перед Рёдзи.
Происхождение имени: фамилия «Кацураги» происходит от названия корабля императорского флота Японии. Имя «Мисато» заимствовано у героини из манги Минако Нариты «Misato Izumi of Aitsu».
Приметы: длинные иссиня-чёрные волосы, чёлка короткая. Глаза карие. Почти не пользуется косметикой. Шрам-рубец под грудью. Носит амулет в виде массивного греческого креста.
