Зараженные — гуманоиды и роботы, заражённые чумой техноцит. Большинство зараженных не имеет каких-либо существенных способностей дальнего боя. Места постоянного обитания заражённых - это Руины Орокин, Эрида и Тёмные Сектора. В обитаемых зонах остальных планет заражённые появляются только при Вспышке заражения или Сигнале тревоги.
Техноцит был создан, а затем использован Орокин для борьбы с Владеющими Разумом. Многое в игровой вселенной представлено весьма неоднозначно, однако, можно предположить, что этот вирус поражает виды с общим геном.
Сами Зараженные представляют собой смешанные группы из представителей Корпуса и Гринир, тех, кто осмелился проникнуть в Руины и тех, кто не успел убежать от заражения. Заражение живых организмов и трансформация их молекулярного строения проходит значительно быстрее, чем у крупных синтетических кораблей или техники. Наниты-заразители быстро разрушают органические ткани и начинают превращать существующую особь в новый организм, с характеристиками и функциями, идеальными для выживания и самозащиты. Даже Цефалоны не могут сопротивляться заражению - примером тому является Цефалон Джордас, превратившийся в огромного Голема. Оригинальная версия вируса не могла взять контроль над техникой, однако Алад V, попав под заражение, воссоздал вирус Улья, что позволило взять под контроль как роботов охраны, так и уничтожить весь Флот Корпуса над Эридой. Несмотря на кажущуюся хаотичной стаю, сами Зараженные действуют очень скоординировано, что показано в квесте "После пробуждения", когда Тенно пришлось взорвать комплекс с помощью бомбы, в то время как Зараженные пытались помешать этому.
Варфреймы Тенно имеют иммунитет к заражению из-за определенных сопротивляемостей их Био-Металлических экзоскелетов, посему могут отправляться в места заражения, не боясь потерять Варфрейм.