Лотос - таинственный персонаж, который помогает игрокам в различных миссиях.
На протяжении миссий Лотос будет сообщать игрокам о приближающихся противниках, об их цели миссии и говорить о сигналах тревоги, поднятых противником. Во время миссий выживания она сообщает о появляющихся капсулах жизнеобеспечения, во время миссий раскопок - о начале работы активированных экскаваторов. Также Лотос будет сообщать о сильных врагах, когда они будут рядом (Древние Заражённые, сильные МОА, тяжелые Гринир).
Иногда во время миссий Лотос будет отменять старое задание и давать новое. Например, на миссии шпионажа при активации тревоги во всех трёх хранилищах данных или взлома Лотос может приказать вам забыть о предыдущей цели и истребить всех противников, при этом сменяется тип миссии на зачистку. Любые объекты, которые хоть как-то касались цели предыдущей миссии, перестанут быть важными для выполнения задания.